Selain itu Maudy Ayunda juga sempat dikabarkan pernah menjadi kekasih dari penyanyi Vidi Aldiano. Namun keduanya kompak untuk tidak membuat pernyataan apapun terkait masa lalu keduanya. Dan hingga saat ini keduanya masih dekat sebagai sahabat.
Hubungan asmaranya yang terkuak ke publik ialah ketika menjalin kasih dengan seorang pengusaha sukses bernama Arsyah Rasyid. Keduanya mulai berpacaran sejak tahun 2015 dan langgeng hingga 5 tahun.
Mereka juga sempat menjalani hubungan jarak jauh lantaran Maudy harus melanjutkan pendidikannya di Oxford University, London, Inggris. Disebut sebagai pasangan serasi dan didoakan menikah, sayangnya jalinan cinta keduanya justru kandas pada 2020.
Setelah putus dari Arsyah Rasyid, aktris yang mahir Bahasa Spanyol, Bahasa Mandarin, dan Bahasa Inggris ini tidak pernah memperlihatkan pasangannya di publik sehingga seringkali dikira sedang sendiri.
Namun tiba-tiba ia mengumumkan akan melepas masa lajangnya pada 22 Mei 2022 dengan pria keturunan Korea Selatan dan berkebangsaan Amerika Serikat bernama Jesse Choi yang ternyata merupakan teman satu almamater di Stanford University.
Maudy Ayunda dan Jesse Choi melangsungkan akad nikah pada 22 Mei 2022 di kediaman Maudy di Cilandak Barat, Jakarta Selatan.
Jesse yang merupakan seorang investor ini menceritakan dalam blog pribadinya jika ia bertemu dengan sang istri di tahun pertama kuliah di Stanford.
Mereka sudah menjalin hubungan pacaran cukup lama dan keduanya menutupi kedekatan mereka dari publik hingga menikah.